כיום, ישנם בבתי המשפט בארץ תופעה הולכת וגוברת והיא; עדים מומחים ובוררים וזאת בשל העומס ההולך וגדל בבתי המשפט. לאחר שהשופט שמע את הטענות שהוגשו בפניו מתחילים בשלב הראיות והעדים של כל אחד מהצדדים. התובע והנתבע מנסים להצדיק את מהימנותם דרך הבאת עדים לדיון בבית המשפט.
כאשר הגרפולוג המומחה מתבקש להגיש את חוות דעתו המשפטית בנושא זיוף חתימה או אימות כתב יד, הפנייה נערכת ע"י עורך דינו של התובע ולאחר מכן מגישים את חוות הדעת לבית המשפט ולנתבע שיוכל ללמוד את הממצאים. ברוב המקרים לא מזמינים את הגרפולוג לבית המשפט, אולם במידה וכן, הדבר נקרא חקירה נגדית. במהלך החקירה העו"ד של הנתבע חוקר את הגרפולוג בנושא חוות הדעת המשפטית ומנסה להפריך את העדות שנכתבה ולערער את בטחונו האישי של הגרפולוג ובכך להוכיח לשופט שאין למומחה מושג, ושבין מה שנכתב לבין הידע הבסיסי שלו, ישנו פער ענק. הדבר דומה לקרב סכינים ותמיד החלש נופל.
חשוב לזכור שלחקירה נגדית ישנן כמה סיבות עיקריות: הדבר הראשון הוא הצורך לסתור או להוכיח שהעדות של חוות הדעת של המומחה אינה אמינה. הדבר השני הוא להוכיח שלגרפולוג שנותן עדות אין ניסיון. בד"כ העו"ד שואל שאלות לא רלוונטיות ושלא קשורות לחוות הדעת המשפטית.המטרה היא לגרום לעד לשנות את דעתו אחרי שרשם את חוות הדעת.
לדוגמא; כאשר המומחה כתב מספר מאמרים אולם לא הוא רשם אותם אלא המתמחים שלו או אדם אחר והוא חתום בסוף המאמר ולאור זה מוצא העו"ד נקודה מסוימת שהיא נוגדת את חוות דעתו המשפטית.
לפני עדות הגרפולוג בבית המשפט צריכים לבוא מוכנים והדבר הראשון והחשוב הוא להיפגש עם העו"ד שהזמין את חוות הדעת ולעשות סימולציות לפני הדיון בבית המשפט. מדוע? בד"כ עוברים מספר חודשים מיום מסירת חוות הדעת ועד לנתינת עדות בבית משפט וצריך לרענן את הזיכרון לגבי כל העובדות.
בחקירה נגדית ישנן שאלות שגורמות לעד למצב של מתח או לחץ ואז התשובות שלו משתהות או תוקפניות ולכן העו"ד של התובע צריך לעזור לעד המומחה לדעת כיצד לענות על השאלות. נקודה חשובה היא שלעו"ד של התובע אין אפשרות להתערב במהלך החקירה הנגדית.
חשוב לציין, כאשר מגישים חוות דעת משפטית לשופט/ת, היא צריכה להיות קצרה ועניינית, יש צורך להגיש לעו"ד של התובע את חוות הדעת כדי שיוכל לבדוק האם היא כתובה בצורה משפטית בכדי שהשופט/ת יוכלו להבין אותה.
היום בעידן האינטרנט קל לחפש וגם למצוא כישלונות של המומחה דבר זה משמש ראיות נגדו ועוזר לערער אותו. יחד עם זאת, ניתן למצוא מומחים רבים אשר צלחו משפטים כאלה בהצלחה רבה.