במגמת לימודי חשבונאות של מכללת מישלב, מוצעים מגוון של קורסים פרקטיים ומקצועיים שמנתבים את בוגריהם לתעסוקה בתחום. כל בתי העסק מחויבים לנהל קשר עם משרדי הנהלת חשבונות וראיית חשבון על מנת לדווח על פי חוק את ההוצאות וההכנסות השנתיות של העסק. משום כך, קיימת דרישה במשק לאנשי מקצוע בעלי הידע המקצועי, ההיכרות עם החוקים והנהלים בתחומי מיסוי, משכורות, ביטוח לאומי, שיטות דיווח ועוד.
לימודי הנהלת חשבונות מוצעים בכמה דרגות סיווג מקצועי, סוג 1, 2, ו - 3. לימודי הנהלת חשבונות מספקים לתלמידים את הידע הבסיסי ובהמשך, את הידע המתקדם לניהול חשבונותיו של בית עסק, ניהול מאזנים דו"חות, שימוש בתוכנות הממוחשבות, ניתוח המידע החשבונאי ועוד. לימודי הנהלת חשבונות מכינים את המשתתפים בקורס לעסוק בפועל בתחום זה בתום תקופת הלימודים. כמו כן, בכל שלב סיום ניתן להתקדם מעלה בדרגה המקצועית של לימודי הנהלת חשבונות ולהרחיב את אפשרויות התעסוקה.
בוגרי סוג 2 בהנהלת חשבונות כבר יוכלו להפליג אל לימודי קורס חשבי שכר במכללת מישלב. קורס חשבי שכר מכין את תלמידיו לעסוק במשכורות באופן מקצועי, תחום המצריך ידע מדויק ויסודי. כמעט בכל בית עסק ישנו הצורך והתלות במיומנויות של חשבי שכר במשרד הנהלת החשבונות שינהלו את המשכורות בתבונה ועל פי חוק, על מנת להעניק את כל הזכויות לעובדים בצורה ראויה. קורס חשבי שכר מעניק לתלמידיו את היכולת להיות החשבים במשרד, ובעלי הסמכות המקצועית לעסוק בכך.
בנוסף, במגמת חשבונאות של מכללת מישלב, מוצע קורס מזכירות איכותי המקנה לתלמידיו את מיטב יסודות ניהול המשרד, האדמיניסטרציה, השיווק והשירות הנדרשים בתפקיד זה. במסגרת קורס מזכירות נלמדות טכניקות העבודה, מהות התפקיד וחשיבותו, ובכך סיום קורס מזכירות יוכל להיות כרטיס כניסה של בוגרים לעבודה משרדית במשק, במגוון של חברות וארגונים שונים.